南科院定位于社会公益类科研机构后，适应公益性课题研究的需要，涉及院内外的机构做了一系列调整，人员配备，培训，研究生教育大大加强。兼作、依托、挂靠的国家、省部科研机构增多，为南科院改革和发展提供了组织保证。